La Communauté est administrée par un Conseil composé de 34 délégués issus des 16 communes. Chaque commune est représentée par 2 délégués, à l'exception de Ribeauvillé qui en compte 4. Le Conseil élit en son sein un Bureau comprenant 16 membres, dont le président et les 8 vice-présidents.

Des commissions sont chargées d'étudier les différents dossiers qui pourront être débattus en Conseil de Communauté.